Siguiendo el modelo de la iglesia primitiva, La Casa del Señor ha implementado desde hace muchos años los grupos de oración en casa, en los cuales se procura un ambiente cálido y acogedor, de amor mutuo para crecer en el conocimiento y la comunión con Dios. Se prepara una merienda, se cantan alabanzas y se realiza un pequeño estudio bíblico en torno a la mesa, con la posibilidad de que todos opinen y manifiesten sus dudas y puntos de vista.